La historia de Moroni y de todo el archipiélago de las Comoras está escrita por el mar. Situadas en el canal de Mozambique, a mitad de camino entre la costa de África oriental, Madagascar y las rutas hacia Arabia y la India, las islas fueron desde muy temprano una escala natural en el gran comercio del océano Índico, movido por los vientos monzones y los dhows, los veleros árabes de vela latina. Los primeros pobladores llegaron probablemente hacia el siglo VI o VII, en oleadas de origen bantú, austronesio (llegados desde el sudeste asiático vía Madagascar) y, más tarde, árabe y persa.
Con el comercio llegó también el islam. Entre los siglos IX y XV, mercaderes y colonos suajilíes, árabes y shirazíes (según la tradición, persas de Shiraz) se instalaron en las islas y las integraron en la civilización suajili que florecía a lo largo de toda la costa de África oriental, de Mogadiscio a Kilwa y Zanzíbar. Nacieron así ciudades-Estado costeras de comerciantes musulmanes, con casas de piedra de coral, mezquitas y una élite que vivía del tráfico de esclavos, oro, marfil, especias, ámbar gris y tortuga.
Moroni, en la costa oeste de Ngazidja (Gran Comora), fue una de esas ciudades portuarias. Su nombre suele traducirse como 'en el corazón del fuego', por su ubicación al pie del volcán Karthala. Como los demás asentamientos de las islas, vivía del comercio marítimo y del vaivén de los dhows que unían las Comoras con Zanzíbar, Kilwa, la costa suajili y el mundo árabe, en una red de intercambios que dio a las islas su carácter mestizo, africano y musulmán a la vez.
A partir de la Edad Media, cada isla del archipiélago se fragmentó en pequeños sultanatos rivales. En Gran Comora llegaron a convivir hasta una decena de sultanatos, gobernados por dinastías locales que combinaban el linaje africano con prestigiosos orígenes árabes o shirazíes reivindicados. Estos sultanes rivalizaban por el control del comercio, se aliaban y se hacían la guerra, y levantaban en sus capitales mezquitas y palacios de piedra que todavía hoy se conservan.
En ese contexto se construyó la joya de Moroni: la Antigua Mezquita del Viernes, conocida como Ancienne Mosquée du Vendredi o Badjanani. La tradición sitúa la finalización de su construcción un viernes del año 1427, lo que la convierte en una de las mezquitas más antiguas del archipiélago y en un símbolo de la ciudad. Levantada con piedra de coral y roca volcánica, mezcla influencias árabes y suajilíes; su característico minarete —blanco con remates verdes— se añadió más tarde, en 1921, y hoy domina el frente portuario reflejándose en el mar.
Alrededor de la mezquita creció la Vieille Ville o Medina de Moroni, un laberinto de callejones estrechos, puertas de madera tallada, patios interiores y pequeñas mezquitas de barrio, típico de las ciudades suajilíes del Índico. Ese casco antiguo, junto con las medinas de Iconi, Mutsamudu, Domoni y otras, sería reconocido casi seis siglos después, en 2026, como Patrimonio Mundial de la Humanidad.
En el siglo XIX, las Comoras entraron en la órbita del imperio colonial francés. Francia estableció un protectorado sobre Mayotte en 1841 y fue extendiendo su dominio a las demás islas entre 1886 y 1892, hasta convertir todo el archipiélago en colonia. Durante décadas, las islas se administraron desde Mayotte, y la capital colonial estuvo en Dzaoudzi, en el islote de Pamandzi. Moroni, aunque era la ciudad más importante de Gran Comora, quedó en un segundo plano administrativo.
Eso cambió a mediados del siglo XX. En 1958, la capital del territorio se trasladó de Dzaoudzi a Moroni, que pasó a ser el centro político y administrativo de las Comoras. La ciudad creció, se modernizó y concentró las instituciones, el puerto y el comercio. Bajo la administración francesa se desarrolló también la economía de plantación que todavía define al país: la vainilla, el clavo de olor y, sobre todo, el ylang-ylang, cuya esencia perfumada convirtió a las islas en proveedoras clave de la industria de la perfumería mundial, valiéndoles el apodo de 'islas de los perfumes'.
El 6 de julio de 1975, tras un referéndum, las Comoras declararon su independencia de Francia. Sin embargo, la isla de Mayotte votó por seguir siendo francesa y permanece hasta hoy bajo administración de Francia, una disputa territorial que Comoras nunca aceptó y que sigue reclamando. Moroni se convirtió en la capital del nuevo Estado independiente: la Unión de las Comoras.
La independencia abrió una de las etapas más convulsas de la historia africana reciente. Apenas un mes después de proclamarla, el presidente Ahmed Abdallah fue derrocado en un golpe de Estado, el primero de una larga serie. Se calcula que entre 1975 y 2008 las Comoras vivieron una veintena de golpes y tentativas de golpe, aproximadamente uno cada año y medio, lo que dio al país la triste fama de ser una de las naciones más inestables del mundo.
Uno de los personajes más siniestros de esa etapa fue el mercenario francés Bob Denard, que intervino repetidamente en la política comorense a lo largo de casi dos décadas. Participó en varios golpes —incluido el que en 1978 derrocó y costó la vida al revolucionario Ali Soilih, un líder de inspiración maoísta que había intentado una transformación radical de la sociedad— y llegó a controlar de hecho el país durante años, al frente de la guardia presidencial. Su sombra sobre Moroni no se disipó hasta que Francia intervino militarmente en 1995 para expulsarlo.
A la inestabilidad política se sumaron las tensiones entre las islas: en 1997, Anjouan y Mohéli intentaron separarse de la Unión, en una crisis que solo se resolvió a comienzos de los años 2000 con una nueva Constitución que dio amplia autonomía a cada isla y estableció una presidencia rotativa. Pese a todo, Moroni siguió siendo el centro de la vida nacional, sede del gobierno, el parlamento y las instituciones de un país pequeño, pobre pero resiliente.
La Moroni actual es una capital pequeña y tranquila, de unos 60.000 habitantes, que conserva su aire de puerto suajili al mismo tiempo que crece con nuevos barrios, una gran mezquita moderna financiada con ayuda de los países del Golfo y una modesta actividad de servicios. La economía del país sigue dependiendo de la agricultura de exportación —vainilla, clavo, ylang-ylang—, de la pesca y, muy especialmente, de las remesas de la enorme diáspora comorense en Francia, mucho más numerosa que la población de algunas islas.
El turismo es todavía incipiente. Comoras recibe muy pocos visitantes por año, lo que hace de Moroni un destino genuino y poco masificado, donde el viajero encuentra hospitalidad, precios en efectivo y una vida cotidiana marcada por el islam, el mar y el volcán. La ciudad ofrece pocos servicios de lujo, pero a cambio una autenticidad difícil de hallar en destinos más desarrollados del Índico.
El gran hito reciente llegó el 25 de julio de 2026, cuando la 48.ª sesión del Comité del Patrimonio Mundial de la UNESCO, reunida en Busan (Corea del Sur), inscribió los 'Sultanatos Históricos de las Comoras': seis medinas seculares —cuatro en Gran Comora, entre ellas la de Moroni, y dos en Anjouan— como Patrimonio Mundial de la Humanidad, los primeros sitios del país en la lista. La Antigua Mezquita del Viernes, con su minarete verde sobre el puerto de dhows, se convirtió en la imagen de un reconocimiento que promete impulsar la preservación de estos frágiles tesoros y, quizás, el despegue turístico de la capital comorense.